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Ponencia Javier Ibáñez redvitis sobre transcriptómica y asociación genética

Fenómica y asocicación genética – Red Vitis

Fenómica y asocicación genética

El sufijo -oma hace referencia a estudios masivos y en conjunto. En el caso del fenoma es el conjunto de todos los fenotipos expresados por una célula, tejido, órgano, organismo o especie. El fenotipo es la manifestación del genotipo en un determinado ambiente. Por lo tanto, el fenoma al incluir los rasgos fenotípicos, incluye los rasgos debidos a la genética y al ambiente. La fenómica es el estudio de la naturaleza de los fenotipos y la forma en que se determinan, en particular cuando se estudia en relación con el conjunto de todos los genes (genómica) o todas las proteínas (proteómica).

¿Puede la fenómica estudiar cuestiones relacionadas con la viticultura? Un ejemplo es el grupo de fenómica del Julius Kühn Institut, el cual lleva años trabajando en sistemas para fenotipado de la vid. Con análisis de imagen pueden tener estimaciones de número de racimos, número de bayas, diámetro de bayas, etc.

Por otro lado, la asociación genética consiste en analizar el ADN de dos grupos, donde un grupo se ve afectado por algún carácter diferenciado fenotípicamente y el otro no lo tiene. Si se observan diferencias genéticas entre los dos grupos estas podrían ser la causa de la diferencia observada. Estos estudios pretenden dar respuesta a saber si existen correlaciones entre las variaciones que observamos en el fenotipo y el genotipo.

Un ejemplo de asociación genética en viticultura fue un estudio para determinar qué confería el sabor a “Moscatel” a las variedades. Realizando estudios sobre variedades y clones que presentan sabor a Moscatel y otras que no, se llegó a descubrir un polimorfismo sobre el gen VvDXS por el cual siempre, salvo en un caso, confería el sabor a Moscatel.

Javier Ibáñez, científico titular del CSIC en el ICVV e investigador del grupo Vitigen expuso la siguiente ponencia en la Jornada Científica ‘¿Qué pueden aportar las ómicas en Viticultura?’ del día 31 de marzo del 2017. Esta jornada estuvo enmarcada en las Actividades de la Red de Excelencia para la Investigación en Viticultura (RedVitis).

      • Introducción a la fenómica
      • ¿Es útil para la viticultura? (min. 02:45)
      • Asociación genética. ¿Para qué sirve? (min.07:14)
      • Asociación genética. ¿Qué se necesita? (min.13:18)
      • Asociación genética. Tipos (asociación a escala genómica y a escala génica (min.26:13)
      • Resumen y perspectivas (min.33:49)
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Si quieres conocer con más detalle contenidos relacionados de la jornada sobre las ómicas, también puedes visitar:

Transcriptómica, principio y aplicaciones – RedVitis

El genoma de referencia de la vid – RedVitis

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